Présentation de la formation

La mention Bio-informatique est une formation de niveau master (M1-M2) accréditée par le Ministère de l'Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l'Innovation (MESRI).

Cette mention est proposée par 11 établissements en France, chacun déclinant des parcours spécifiques :

Université de Nantes (NANTES CEDEX 2) Formation initiale Formation continue Alternance Hybride
U Lille (LILLE) Formation initiale Formation continue
Université de Bordeaux (BORDEAUX) Formation initiale Formation continue
Université de Rouen (MONT ST AIGNAN CEDEX) Formation initiale Formation continue Alternance Apprentissage
UNIVERSITE DE PARIS (PARIS) Formation initiale Formation continue Alternance Apprentissage
Université Paris-Saclay (ST AUBIN) Formation initiale Formation continue
Université Lyon-I (VILLEURBANNE CEDEX) Formation initiale Formation continue Alternance
Aix-Marseille Université (MARSEILLE CEDEX 07) Formation initiale Formation continue
Université de Rennes 1 (RENNES CEDEX) Formation initiale
UT3 (TOULOUSE CEDEX 9) Formation initiale Formation continue
Université Clermont Auvergne (CLERMONT FERRAND CEDEX 1) Formation initiale Formation continue

Pour connaître le détail des Unités d'Enseignement (UE) et des parcours spécifiques à chaque établissement, consultez les fiches officielles sur monmaster.gouv.fr.

Volume horaire

Entre 300 et 400 heures par année universitaire, réparties entre :

Cours Magistraux (CM)
Travaux Dirigés (TD)
Projets
Stage de 2 à 3 mois en M1
Stage de 4 à 6 mois (ou alternance) en M2

Objectifs pédagogiques

La mention Bio-informatique vise à former des professionnels capables de :

Maîtriser les concepts avancés en bio-informatique et biologie computationnelle
Développer des algorithmes et outils pour l'analyse de données biologiques
Concevoir et administrer des bases de données biologiques
Appliquer des méthodes d'apprentissage automatique à des problématiques biologiques
Traiter des signaux biologiques et médicaux
Assurer la cybersécurité des systèmes d'information en santé
Travailler en environnement interdisciplinaire (biologie, informatique, santé)

Programme détaillé

M1 — Première année de master

Objectif : Approfondissement disciplinaire et méthodologique

Volume horaire : 300-400h (CM, TD, projets + stage 2-3 mois)

M1.1 — Optimisation et programmation linéaire

Notions abordées :

algorithme
boucle
recherche
tri
performance
théâtre postdramatique

M1.2 — Génie logiciel et tests

Notions abordées :

système d'exploitation
processus
test
débogage
liste chaînée
pile
Von Neumann
processeur

M1.3 — Bio-informatique

Notions abordées :

informatique
algorithme
donnée
complexité
abstraction
automatisation

M1.4 — Cryptographie

Notions abordées :

POO
classe

M1.5 — Traitement du signal

Notions abordées :

traitement
signal
algorithme
donnée
complexité
abstraction
automatisation

M1.6 — Apprentissage automatique

Notions abordées :

apprentissage
automatique
algorithme
donnée
complexité
abstraction
automatisation

M1.7 — Méthodes avancées et outils numériques

Notions abordées :

méthodologie
modélisation
analyse de données
outils logiciels

M2 — Deuxième année de master

Objectif : Spécialisation et préparation à la professionnalisation ou à la thèse

Volume horaire : 300-400h (parcours spécialisé + mémoire/stage 4-6 mois)

M2.1 — Cybersécurité

Notions abordées :

cybersécurité
algorithme
donnée
complexité
abstraction
automatisation

M2.2 — Traitement automatique des langues

Notions abordées :

traitement
automatique
langues
algorithme
donnée
complexité
abstraction
automatisation

M2.3 — Spécialisation : Analyse de données génomiques

Notions abordées :

analyse
données
génomiques
biologie
bio-informatique
diagnostic médical et technologie de traitement
Activités spécialisées
chercheurs de la recherche publique

M2.4 — Spécialisation : Bio-informatique pour la santé

Notions abordées :

informatique
santé
biologie
bio-informatique
diagnostic médical et technologie de traitement
Modélisation
ingénieurs et cadres d'étude
enseignants de l'enseignement supérieur

M2.5 — Spécialisation : Bio-informatique pour les biologistes

Notions abordées :

informatique
biologistes
biologie
bio-informatique
diagnostic médical et technologie de traitement
Santé humaine et action sociale
enseignants de l'enseignement supérieur
études et développement informatique